Brutus là con của Marcus Junius Brutus Già và Servilia Caepionis. Cha ông là sư đoàn trưởng (legatus) của Pompey vĩ đại và mẹ là chị cùng cha khác mẹ (hay cùng mẹ khác cha) của Cato Trẻ. Chú của Brutus nhận nuôi ông từ khi còn là đứa trẻ và có một giai đoạn Brutus cũng được gọi với tên Quintus Servilius Caepio Brutus.

Brutus rất coi trọng người chú của mình và sự nghiệp chính trị của ông bắt đầu khi ông trở thành trợ lý của Cato trong giai đoạn điều hành Kypros. Trong thời gian này, ông tự làm giàu cho bản thân bằng việc cho vay nặng lãi. Ông trở lại Roma với tư cách là một người giàu có, nơi ông cưới Claudia Pulchra. Từ lần đầu xuất hiện tại Viện nguyên lão, Brutus đã được xếp ở phe Quý nhân (Optimates), một phe cánh bảo thủ đối lập với Tam đầu chế là Marcus Licinius Crassus, Gnaeus Pompeius Magnus và Gaius Julius Caesar.